O Estudo teve como objetivo principal realizar um levantamento, através de simulações e comparações, sobre a qualidade ambiental do Complexo Lagunar Sul de Santa Catarina. O complexo lagunar é composto por oito lagoas, sendo as mais importantes a Lagoa do Mirim, de Imaruí e de Santo Antônio, que possui como principal contribuinte fluvial o rio Tubarão.
Dentre os tópicos de discussão do Estudo Ambiental que foram realizados estão: avaliação do grau de penetração das águas do rio Tubarão no interior da lagoa de Imaruí, avaliação da influência do aterro da ponta de Cabeçudas sobre a circulação das águas naquela lagoa, investigação da viabilidade de remover parcialmente ou totalmente o aterro existente para melhorar a circulação d’água entre as lagoas e avaliação do destino e das concentrações de uma mancha de poluentes nas lagoas, caso ocorra um derrame acidental de substâncias perigosas, causado por um acidente rodoviário na nova ponte a ser construída.

            O escopo foi dividido em duas componentes, sendo a primeira compreendendo uma modelagem matemática, planejamento estratégico, elaboração de cenários, definição de estratégias e prognóstico e validação de resultados.  A segunda componente envolveu a elaboração do Programa de Gestão de Resíduos Sólidos Industriais.

            As conclusões do Estudo permitem fundamentar a decisão do Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais Renováveis – IBAMA quanto à retirada ou não, do aterro atualmente construído para permitir a Travessia entre Cabeçudas a Imaruí, no município de Laguna/SC.